Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms