Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDKL1Q00532 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms