Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms