Protein–RNA interactions for Protein: P98177

FOXO4, Forkhead box protein O4, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO4P98177 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXO4P98177 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms