Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNRPNP63162 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms