Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms