Protein–RNA interactions for Protein: P62316

SNRPD2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD2P62316 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNRPD2P62316 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms