Protein–RNA interactions for Protein: P57730

CARD18, Caspase recruitment domain-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD18P57730 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CARD18P57730 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CARD18P57730 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CARD18P57730 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CARD18P57730 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CARD18P57730 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CARD18P57730 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CARD18P57730 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CARD18P57730 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CARD18P57730 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CARD18P57730 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CARD18P57730 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CARD18P57730 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CARD18P57730 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CARD18P57730 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CARD18P57730 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CARD18P57730 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CARD18P57730 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CARD18P57730 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CARD18P57730 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CARD18P57730 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CARD18P57730 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CARD18P57730 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CARD18P57730 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CARD18P57730 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CARD18P57730 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CARD18P57730 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CARD18P57730 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CARD18P57730 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CARD18P57730 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CARD18P57730 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CARD18P57730 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CARD18P57730 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CARD18P57730 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CARD18P57730 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CARD18P57730 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CARD18P57730 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CARD18P57730 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CARD18P57730 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CARD18P57730 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CARD18P57730 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CARD18P57730 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CARD18P57730 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CARD18P57730 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CARD18P57730 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CARD18P57730 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CARD18P57730 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CARD18P57730 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CARD18P57730 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CARD18P57730 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CARD18P57730 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CARD18P57730 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CARD18P57730 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CARD18P57730 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CARD18P57730 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CARD18P57730 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CARD18P57730 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CARD18P57730 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CARD18P57730 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CARD18P57730 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CARD18P57730 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CARD18P57730 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CARD18P57730 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CARD18P57730 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CARD18P57730 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CARD18P57730 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CARD18P57730 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CARD18P57730 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CARD18P57730 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CARD18P57730 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CARD18P57730 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CARD18P57730 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CARD18P57730 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CARD18P57730 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CARD18P57730 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CARD18P57730 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CARD18P57730 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CARD18P57730 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CARD18P57730 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CARD18P57730 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CARD18P57730 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CARD18P57730 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CARD18P57730 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CARD18P57730 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CARD18P57730 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CARD18P57730 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CARD18P57730 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CARD18P57730 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CARD18P57730 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CARD18P57730 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CARD18P57730 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CARD18P57730 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CARD18P57730 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CARD18P57730 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CARD18P57730 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CARD18P57730 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CARD18P57730 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CARD18P57730 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CARD18P57730 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CARD18P57730 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms