Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP9P55211 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP9P55211 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP9P55211 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP9P55211 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP9P55211 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP9P55211 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP9P55211 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP9P55211 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP9P55211 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP9P55211 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP9P55211 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP9P55211 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP9P55211 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP9P55211 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP9P55211 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP9P55211 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP9P55211 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP9P55211 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP9P55211 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP9P55211 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP9P55211 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP9P55211 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP9P55211 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP9P55211 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP9P55211 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP9P55211 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASP9P55211 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP9P55211 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP9P55211 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP9P55211 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP9P55211 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP9P55211 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP9P55211 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP9P55211 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP9P55211 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP9P55211 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP9P55211 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP9P55211 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP9P55211 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP9P55211 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP9P55211 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP9P55211 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP9P55211 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP9P55211 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP9P55211 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP9P55211 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP9P55211 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP9P55211 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP9P55211 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP9P55211 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP9P55211 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP9P55211 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP9P55211 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP9P55211 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP9P55211 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP9P55211 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP9P55211 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP9P55211 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASP9P55211 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CASP9P55211 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CASP9P55211 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CASP9P55211 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CASP9P55211 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CASP9P55211 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CASP9P55211 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CASP9P55211 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CASP9P55211 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CASP9P55211 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CASP9P55211 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CASP9P55211 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CASP9P55211 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CASP9P55211 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CASP9P55211 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CASP9P55211 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CASP9P55211 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CASP9P55211 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CASP9P55211 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CASP9P55211 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CASP9P55211 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CASP9P55211 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CASP9P55211 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CASP9P55211 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CASP9P55211 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CASP9P55211 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CASP9P55211 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CASP9P55211 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CASP9P55211 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CASP9P55211 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CASP9P55211 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CASP9P55211 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CASP9P55211 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CASP9P55211 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CASP9P55211 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CASP9P55211 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CASP9P55211 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CASP9P55211 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CASP9P55211 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CASP9P55211 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CASP9P55211 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms