Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP7P55210 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP7P55210 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP7P55210 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP7P55210 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP7P55210 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP7P55210 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP7P55210 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP7P55210 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP7P55210 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP7P55210 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP7P55210 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP7P55210 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP7P55210 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP7P55210 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP7P55210 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP7P55210 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP7P55210 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP7P55210 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP7P55210 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP7P55210 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP7P55210 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP7P55210 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP7P55210 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP7P55210 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP7P55210 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP7P55210 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP7P55210 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP7P55210 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP7P55210 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP7P55210 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP7P55210 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP7P55210 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP7P55210 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP7P55210 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP7P55210 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP7P55210 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP7P55210 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP7P55210 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP7P55210 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP7P55210 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP7P55210 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP7P55210 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP7P55210 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP7P55210 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP7P55210 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP7P55210 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP7P55210 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP7P55210 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP7P55210 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP7P55210 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP7P55210 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP7P55210 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP7P55210 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP7P55210 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP7P55210 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP7P55210 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP7P55210 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP7P55210 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP7P55210 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP7P55210 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP7P55210 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP7P55210 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP7P55210 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP7P55210 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP7P55210 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP7P55210 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP7P55210 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP7P55210 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP7P55210 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP7P55210 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP7P55210 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP7P55210 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP7P55210 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP7P55210 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP7P55210 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP7P55210 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP7P55210 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP7P55210 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP7P55210 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP7P55210 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP7P55210 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP7P55210 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP7P55210 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP7P55210 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP7P55210 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP7P55210 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP7P55210 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP7P55210 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP7P55210 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP7P55210 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP7P55210 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP7P55210 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP7P55210 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP7P55210 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP7P55210 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP7P55210 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP7P55210 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP7P55210 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP7P55210 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms