Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRPF1P55201 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms