Protein–RNA interactions for Protein: P48729

CSNK1A1, Casein kinase I isoform alpha, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1A1P48729 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1A1P48729 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms