Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms