Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms