Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms