Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms