Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms