Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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PTPRBP23467 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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PTPRBP23467 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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PTPRBP23467 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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PTPRBP23467 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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PTPRBP23467 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRBP23467 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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