Protein–RNA interactions for Protein: P22362

CCL1, C-C motif chemokine 1, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL1P22362 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL1P22362 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL1P22362 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL1P22362 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL1P22362 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL1P22362 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL1P22362 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL1P22362 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL1P22362 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL1P22362 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL1P22362 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL1P22362 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL1P22362 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL1P22362 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL1P22362 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL1P22362 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL1P22362 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL1P22362 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL1P22362 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL1P22362 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL1P22362 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL1P22362 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL1P22362 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL1P22362 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL1P22362 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL1P22362 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL1P22362 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL1P22362 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL1P22362 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL1P22362 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL1P22362 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL1P22362 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL1P22362 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL1P22362 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL1P22362 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL1P22362 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL1P22362 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL1P22362 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL1P22362 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL1P22362 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL1P22362 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL1P22362 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL1P22362 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL1P22362 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL1P22362 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL1P22362 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL1P22362 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL1P22362 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL1P22362 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL1P22362 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL1P22362 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL1P22362 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL1P22362 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL1P22362 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL1P22362 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL1P22362 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL1P22362 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL1P22362 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL1P22362 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL1P22362 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL1P22362 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL1P22362 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL1P22362 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL1P22362 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL1P22362 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL1P22362 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL1P22362 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL1P22362 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL1P22362 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL1P22362 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL1P22362 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL1P22362 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL1P22362 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL1P22362 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL1P22362 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL1P22362 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL1P22362 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL1P22362 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL1P22362 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL1P22362 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL1P22362 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL1P22362 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL1P22362 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL1P22362 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL1P22362 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL1P22362 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL1P22362 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL1P22362 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL1P22362 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL1P22362 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL1P22362 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL1P22362 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL1P22362 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL1P22362 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL1P22362 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL1P22362 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL1P22362 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL1P22362 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL1P22362 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL1P22362 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms