Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB1P20618 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms