Protein–RNA interactions for Protein: P15941

MUC1, Mucin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC1P15941 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MUC1P15941 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MUC1P15941 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MUC1P15941 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MUC1P15941 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MUC1P15941 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MUC1P15941 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MUC1P15941 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MUC1P15941 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MUC1P15941 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MUC1P15941 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MUC1P15941 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MUC1P15941 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MUC1P15941 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MUC1P15941 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MUC1P15941 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MUC1P15941 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MUC1P15941 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MUC1P15941 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MUC1P15941 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MUC1P15941 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MUC1P15941 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MUC1P15941 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MUC1P15941 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MUC1P15941 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MUC1P15941 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MUC1P15941 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MUC1P15941 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MUC1P15941 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MUC1P15941 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MUC1P15941 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MUC1P15941 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MUC1P15941 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MUC1P15941 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MUC1P15941 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MUC1P15941 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MUC1P15941 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MUC1P15941 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MUC1P15941 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MUC1P15941 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MUC1P15941 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MUC1P15941 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MUC1P15941 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MUC1P15941 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MUC1P15941 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MUC1P15941 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MUC1P15941 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MUC1P15941 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MUC1P15941 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MUC1P15941 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MUC1P15941 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MUC1P15941 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MUC1P15941 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MUC1P15941 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MUC1P15941 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MUC1P15941 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MUC1P15941 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MUC1P15941 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MUC1P15941 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MUC1P15941 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MUC1P15941 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MUC1P15941 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MUC1P15941 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MUC1P15941 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MUC1P15941 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MUC1P15941 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MUC1P15941 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MUC1P15941 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MUC1P15941 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MUC1P15941 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MUC1P15941 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MUC1P15941 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MUC1P15941 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MUC1P15941 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MUC1P15941 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MUC1P15941 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MUC1P15941 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MUC1P15941 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MUC1P15941 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MUC1P15941 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MUC1P15941 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MUC1P15941 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MUC1P15941 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MUC1P15941 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MUC1P15941 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MUC1P15941 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MUC1P15941 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MUC1P15941 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MUC1P15941 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MUC1P15941 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MUC1P15941 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MUC1P15941 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MUC1P15941 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MUC1P15941 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MUC1P15941 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MUC1P15941 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MUC1P15941 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MUC1P15941 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MUC1P15941 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MUC1P15941 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms