Protein–RNA interactions for Protein: P0DMC3

APELA, Apelin receptor early endogenous ligand, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APELAP0DMC3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
APELAP0DMC3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms