Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
C4AP0C0L4 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms