Protein–RNA interactions for Protein: O75676

RPS6KA4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA4O75676 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPS6KA4O75676 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPS6KA4O75676 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPS6KA4O75676 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPS6KA4O75676 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPS6KA4O75676 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPS6KA4O75676 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPS6KA4O75676 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPS6KA4O75676 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KA4O75676 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KA4O75676 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KA4O75676 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KA4O75676 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KA4O75676 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KA4O75676 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KA4O75676 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KA4O75676 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KA4O75676 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KA4O75676 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KA4O75676 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KA4O75676 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KA4O75676 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KA4O75676 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KA4O75676 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KA4O75676 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KA4O75676 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KA4O75676 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KA4O75676 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KA4O75676 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KA4O75676 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KA4O75676 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KA4O75676 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KA4O75676 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KA4O75676 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KA4O75676 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KA4O75676 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KA4O75676 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KA4O75676 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KA4O75676 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KA4O75676 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KA4O75676 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KA4O75676 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KA4O75676 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KA4O75676 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KA4O75676 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KA4O75676 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KA4O75676 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KA4O75676 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KA4O75676 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KA4O75676 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KA4O75676 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KA4O75676 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KA4O75676 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KA4O75676 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KA4O75676 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KA4O75676 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KA4O75676 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KA4O75676 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KA4O75676 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KA4O75676 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KA4O75676 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KA4O75676 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KA4O75676 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KA4O75676 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KA4O75676 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KA4O75676 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KA4O75676 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KA4O75676 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KA4O75676 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KA4O75676 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KA4O75676 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KA4O75676 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS6KA4O75676 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms