Protein–RNA interactions for Protein: O60225

SSX5, Protein SSX5, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX5O60225 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX5O60225 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX5O60225 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX5O60225 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX5O60225 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX5O60225 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX5O60225 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX5O60225 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX5O60225 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX5O60225 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX5O60225 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX5O60225 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX5O60225 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX5O60225 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX5O60225 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX5O60225 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX5O60225 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX5O60225 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX5O60225 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX5O60225 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX5O60225 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX5O60225 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX5O60225 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX5O60225 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX5O60225 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX5O60225 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX5O60225 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX5O60225 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX5O60225 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX5O60225 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX5O60225 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX5O60225 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX5O60225 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX5O60225 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX5O60225 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX5O60225 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX5O60225 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX5O60225 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX5O60225 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX5O60225 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX5O60225 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX5O60225 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX5O60225 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX5O60225 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX5O60225 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX5O60225 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX5O60225 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX5O60225 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX5O60225 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX5O60225 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX5O60225 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX5O60225 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX5O60225 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX5O60225 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX5O60225 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX5O60225 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX5O60225 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX5O60225 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX5O60225 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX5O60225 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX5O60225 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX5O60225 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX5O60225 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX5O60225 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX5O60225 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX5O60225 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX5O60225 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX5O60225 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX5O60225 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX5O60225 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX5O60225 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX5O60225 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX5O60225 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX5O60225 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX5O60225 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX5O60225 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX5O60225 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX5O60225 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX5O60225 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX5O60225 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX5O60225 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX5O60225 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX5O60225 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX5O60225 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX5O60225 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX5O60225 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX5O60225 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX5O60225 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX5O60225 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX5O60225 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX5O60225 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX5O60225 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX5O60225 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX5O60225 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX5O60225 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX5O60225 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX5O60225 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX5O60225 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX5O60225 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX5O60225 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms