Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRTO14522 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
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