Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H7C1D1 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H7C1D1 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H7C1D1 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H7C1D1 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H7C1D1 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H7C1D1 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
H7C1D1 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
H7C1D1 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H7C1D1 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H7C1D1 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H7C1D1 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
H7C1D1 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
H7C1D1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H7C1D1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H7C1D1 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H7C1D1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H7C1D1 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
H7C1D1 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H7C1D1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H7C1D1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H7C1D1 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H7C1D1 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H7C1D1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H7C1D1 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H7C1D1 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H7C1D1 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H7C1D1 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H7C1D1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H7C1D1 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H7C1D1 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H7C1D1 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H7C1D1 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H7C1D1 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H7C1D1 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H7C1D1 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
H7C1D1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H7C1D1 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H7C1D1 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H7C1D1 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
H7C1D1 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H7C1D1 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H7C1D1 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H7C1D1 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H7C1D1 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
H7C1D1 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H7C1D1 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H7C1D1 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
H7C1D1 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H7C1D1 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H7C1D1 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
H7C1D1 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H7C1D1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H7C1D1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H7C1D1 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H7C1D1 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H7C1D1 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H7C1D1 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H7C1D1 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H7C1D1 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H7C1D1 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H7C1D1 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H7C1D1 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H7C1D1 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H7C1D1 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
H7C1D1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H7C1D1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H7C1D1 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H7C1D1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H7C1D1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H7C1D1 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H7C1D1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H7C1D1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H7C1D1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H7C1D1 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H7C1D1 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H7C1D1 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H7C1D1 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H7C1D1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H7C1D1 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H7C1D1 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H7C1D1 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H7C1D1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H7C1D1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H7C1D1 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H7C1D1 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H7C1D1 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H7C1D1 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H7C1D1 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H7C1D1 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H7C1D1 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H7C1D1 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H7C1D1 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H7C1D1 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H7C1D1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H7C1D1 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H7C1D1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H7C1D1 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H7C1D1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H7C1D1 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms