Protein–RNA interactions for Protein: H3BN98

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BN98 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BN98 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BN98 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BN98 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BN98 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BN98 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BN98 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BN98 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BN98 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BN98 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BN98 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BN98 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BN98 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BN98 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BN98 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BN98 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BN98 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BN98 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BN98 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BN98 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BN98 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BN98 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BN98 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BN98 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BN98 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BN98 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BN98 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BN98 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BN98 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BN98 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BN98 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BN98 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BN98 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BN98 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BN98 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BN98 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BN98 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BN98 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BN98 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BN98 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BN98 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BN98 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BN98 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BN98 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BN98 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BN98 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BN98 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BN98 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BN98 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BN98 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BN98 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BN98 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BN98 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BN98 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BN98 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BN98 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BN98 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BN98 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BN98 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BN98 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BN98 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BN98 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BN98 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BN98 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BN98 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BN98 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BN98 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BN98 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BN98 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BN98 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BN98 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BN98 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BN98 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BN98 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BN98 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BN98 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BN98 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BN98 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BN98 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BN98 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BN98 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BN98 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BN98 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BN98 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BN98 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BN98 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BN98 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BN98 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BN98 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BN98 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BN98 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BN98 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BN98 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BN98 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BN98 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BN98 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BN98 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BN98 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BN98 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BN98 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms