Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARP3Q9Y6F1 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms