Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
TMED7Q9Y3B3 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMED7Q9Y3B3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMED7Q9Y3B3 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMED7Q9Y3B3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMED7Q9Y3B3 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMED7Q9Y3B3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMED7Q9Y3B3 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMED7Q9Y3B3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMED7Q9Y3B3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMED7Q9Y3B3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMED7Q9Y3B3 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
TMED7Q9Y3B3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMED7Q9Y3B3 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMED7Q9Y3B3 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMED7Q9Y3B3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMED7Q9Y3B3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMED7Q9Y3B3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMED7Q9Y3B3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMED7Q9Y3B3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMED7Q9Y3B3 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMED7Q9Y3B3 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMED7Q9Y3B3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMED7Q9Y3B3 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMED7Q9Y3B3 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMED7Q9Y3B3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMED7Q9Y3B3 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMED7Q9Y3B3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMED7Q9Y3B3 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMED7Q9Y3B3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMED7Q9Y3B3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMED7Q9Y3B3 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMED7Q9Y3B3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMED7Q9Y3B3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMED7Q9Y3B3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMED7Q9Y3B3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TMED7Q9Y3B3 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMED7Q9Y3B3 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMED7Q9Y3B3 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMED7Q9Y3B3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TMED7Q9Y3B3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMED7Q9Y3B3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMED7Q9Y3B3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMED7Q9Y3B3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMED7Q9Y3B3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMED7Q9Y3B3 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMED7Q9Y3B3 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMED7Q9Y3B3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMED7Q9Y3B3 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMED7Q9Y3B3 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMED7Q9Y3B3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMED7Q9Y3B3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMED7Q9Y3B3 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMED7Q9Y3B3 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMED7Q9Y3B3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMED7Q9Y3B3 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMED7Q9Y3B3 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMED7Q9Y3B3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMED7Q9Y3B3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMED7Q9Y3B3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMED7Q9Y3B3 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMED7Q9Y3B3 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms