Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms