Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms