Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULP0

NDRG4, Protein NDRG4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG4Q9ULP0 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NDRG4Q9ULP0 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDRG4Q9ULP0 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDRG4Q9ULP0 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDRG4Q9ULP0 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms