Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATPIF1Q9UII2 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms