Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFDP1Q9UEE9 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms