Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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