Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU7

DBF4, Protein DBF4 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBF4Q9UBU7 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DBF4Q9UBU7 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DBF4Q9UBU7 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms