Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHPF2Q9P2E5 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms