Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC36.2■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CCDC180Q9P1Z9 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms