Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MS4A12Q9NXJ0 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A12Q9NXJ0 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms