Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms