Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDCL3Q9H2J4 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms