Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
CEP44Q9C0F1 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms