Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AMBRA1Q9C0C7 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms