Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA4CQ9C0C4 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms