Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRCC1Q9C099 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRCC1Q9C099 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms