Protein–RNA interactions for Protein: Q9C093

SPEF2, Sperm flagellar protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEF2Q9C093 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SPEF2Q9C093 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPEF2Q9C093 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPEF2Q9C093 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPEF2Q9C093 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPEF2Q9C093 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPEF2Q9C093 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPEF2Q9C093 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPEF2Q9C093 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPEF2Q9C093 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPEF2Q9C093 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPEF2Q9C093 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SPEF2Q9C093 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPEF2Q9C093 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPEF2Q9C093 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPEF2Q9C093 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPEF2Q9C093 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SPEF2Q9C093 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPEF2Q9C093 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPEF2Q9C093 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPEF2Q9C093 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPEF2Q9C093 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPEF2Q9C093 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPEF2Q9C093 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPEF2Q9C093 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPEF2Q9C093 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPEF2Q9C093 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPEF2Q9C093 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SPEF2Q9C093 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPEF2Q9C093 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPEF2Q9C093 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPEF2Q9C093 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPEF2Q9C093 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPEF2Q9C093 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPEF2Q9C093 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SPEF2Q9C093 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPEF2Q9C093 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPEF2Q9C093 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPEF2Q9C093 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPEF2Q9C093 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPEF2Q9C093 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPEF2Q9C093 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPEF2Q9C093 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPEF2Q9C093 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPEF2Q9C093 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPEF2Q9C093 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPEF2Q9C093 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPEF2Q9C093 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPEF2Q9C093 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPEF2Q9C093 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SPEF2Q9C093 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPEF2Q9C093 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPEF2Q9C093 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPEF2Q9C093 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SPEF2Q9C093 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SPEF2Q9C093 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SPEF2Q9C093 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPEF2Q9C093 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPEF2Q9C093 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPEF2Q9C093 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPEF2Q9C093 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPEF2Q9C093 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPEF2Q9C093 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPEF2Q9C093 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPEF2Q9C093 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPEF2Q9C093 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPEF2Q9C093 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPEF2Q9C093 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPEF2Q9C093 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPEF2Q9C093 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
SPEF2Q9C093 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPEF2Q9C093 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPEF2Q9C093 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
SPEF2Q9C093 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPEF2Q9C093 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPEF2Q9C093 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPEF2Q9C093 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPEF2Q9C093 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPEF2Q9C093 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPEF2Q9C093 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPEF2Q9C093 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPEF2Q9C093 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPEF2Q9C093 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPEF2Q9C093 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPEF2Q9C093 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPEF2Q9C093 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPEF2Q9C093 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPEF2Q9C093 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPEF2Q9C093 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPEF2Q9C093 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPEF2Q9C093 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPEF2Q9C093 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPEF2Q9C093 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPEF2Q9C093 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPEF2Q9C093 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPEF2Q9C093 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPEF2Q9C093 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPEF2Q9C093 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPEF2Q9C093 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPEF2Q9C093 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms