Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms