Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NLRP1Q9C000 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms