Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EDEM3Q9BZQ6 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms